欧洲葡萄VvCAX基因家族的鉴定与表达分析
崔小月
尚泓泉
吕中伟
娄玉穗
张柯
河南省农业科学院 园艺研究所,河南 郑州 450002
摘要:CAX(Ca2+/H+ exchanger antiporter)是一类重要的阳离子转运蛋白,在植物生长发育和抵抗非生物胁迫中至关重要.通过生物信息学分析的方法,从欧洲葡萄中共鉴定出5个VvCAX基因,根据其在染色体上的位置依次命名为VvCAX1—VvCAX5,进行了包括理化性质、二级结构、三级结构、跨膜结构域、基因结构、保守基序、系统进化树等分析.结果表明,VvCAX基因家族成员均为疏水蛋白,主要定位于质膜和液泡,包含10~11个跨膜结构域和4个典型的功能域,α-螺旋和无规则卷曲在二级结构中占据主要位置,所有成员三级结构非常相似且均为单体.系统发育分析将VvCAX分为2个亚家族,同一亚家族的VvCAX结构相似,不同亚家族VvCAX的保守基序有差异,且7对VvCAX基因在进化过程中发生了基因的片段复制事件.VvCAX的互作蛋白主要与钙离子转运、钙离子通道和离子转运相关.上游调控因子和启动子顺式作用元件分析结果表明,VvCAX基因可能通过MYB、ERF等转录因子的调控参与激素和胁迫响应,这一推论经表达模式分析得到了验证.通过不同胁迫下的表达分析发现,所有VvCAX基因的表达水平均受ABA的影响,ⅠA亚家族的成员响应创伤、霜霉菌、干旱和低温,而ⅠB亚家族的成员主要与高温有关,ⅠA亚家族的VvCAX基因更有研究价值.
关键词:欧洲葡萄VvCAX基因家族基因结构胁迫响应表达分析
分类号:S663.1(果树园艺)
资助基金:国家葡萄产业技术体系项目(CARS-29-19)河南省科技攻关项目(222102110472)河南省农业科学院优秀青年科技基金项目(2022YQ08)
论文发表日期:2023-11-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:11( 113-123 )
英文信息展开
河南农业科学

河南农业科学

CSTPCD北大核心
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2023,52(11)
所属栏目:园艺