猪繁殖与呼吸综合征病毒感染Marc-145细胞的长链非编码RNA和mRNA转录组分析
张小霞
杨艳青
王秋云
杜俊阳
曹瀚文
梁振普
河南农业大学生命科学学院,河南郑州450002
摘要：为了挖掘猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染Marc-145细胞后宿主细胞长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化,对PRRSV感染Marc-145细胞的lncRNA和mRNA进行转录组测序和分析.生物信息学分析结果显示,PRRSV感染后Marc-145细胞有39个差异表达lncRNA(DElncRNA)和1 320个差异表达mRNA(DEG).进一步的富集分析结果显示,这些DElncRNA和DEG主要富集在氧化磷酸化信号通路.DElncRNA和DEG的联合分析结果显示,与lncRNA共表达的mRNA主要富集在MAPK信号通路、胰岛素信号通路、神经营养素信号通路、AMPK信号通路、HIF-1信号通路、内质网中的蛋白质加工和碳代谢相关的信号通路,这些通路主要与宿主免疫有关.综上,PRRSV感染导致Marc-145 细胞的 lncRNA 和 mRNA 表达谱均发生 了改变,经生物信息 学分析,推测差异表达产 物可能在宿主对PRRSV感染的先天免疫反应中发挥重要作用.
关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒长链非编码RNAmRNAMarc-145细胞转录组
分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)
资助基金：国家自然科学基金(31570151)河南省高等学校重点科研项目(19A210004)河南省重点科技攻关项目(202102110222)
论文发表日期：2023-04-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 127-136 )
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