青花菜花蕾发育LncRNAs内参基因筛选
裴徐梨1
冯鹏宇1
唐征2
李亚梅1
焦鹏1
荆赞革3
1.昆明学院农学与生命科学学院,云南昆明6502142.温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州3250063.昆明学院农学与生命科学学院,云南昆明650214;温州科技职业学院农业与生物技术学院,浙江温州325006
摘要：在分析青花菜花蕾发育过程长链非编码RNA(LncRNAs)的表达中,筛选稳定表达的内参基因至关重要.通过前期高通量测序筛选出16个候选内参基因,利用qRT-PCR技术检测其表达水平,并结合geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个软件对16个LncRNAs在青花菜花蕾不同部位和不同发育时期的表达稳定性进行分析.结果表明,在花蕾不同部位中,geNorm算法认为XLOC_000400、XLOC_008536、XLOC_034059 为最适内参基因;NormFinder 计算 XLOC_021473、XLOC_000400、XLOC_034059 为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_025578表达最稳定.在花蕾不同发育时期中,geNorm算法认为XLOC_000108、XLOC_039609、XLOC_021473 为最适内参基因;NormFinder 计算 XLOC_021473、XLOC_039609、XLOC_000108为最佳内参基因;BestKeeper显示XLOC_034059表达最稳定.综合评估后,在花蕾不同部位和不同发育时期中适宜的内参基因对分别为XLOC_000400/XLOC_008536和XLOC_039609/XLOC_021473.
关键词：青花菜内参基因长链非编码RNA花蕾
分类号：S635.9(蔬菜园艺)
资助基金：云南省地方本科高校(部分)基础研究联合专项(2018FH001-044)浙江省自然科学基金项目(LY18C150006)浙江省农业(蔬菜新品种选育)新品种选育重大科技专项子项目(2021C02065-4-2)温州市科技项目(2019ZX007-2)浙江省教育厅一般项目(Y202045786)
论文发表日期：2023-01-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 125-133 )
英文信息