油莎豆基因组大小、倍性和系统发育分析
王会伟1
朱世新2
张新友1
王艳1
杨铁钢1
张向歌1
王树峰1
李春鑫1
1.河南省农业科学院经济作物研究所,河南郑州 4500022.郑州大学生命科学院,河南郑州450001
摘要:为明确黄淮地区油莎豆主栽品种和特色种质资源的基因组特性及与其近缘类群的系统发育关系,利用流式细胞仪和基因组Survey分析对6个油莎豆材料基因组大小、倍性进行评估,并基于核糖体DNA 的外转录间隔区(External transcribed spacer,ETS)和内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS)序列分析其与近缘类群间的系统发育关系.流式细胞仪分析结果表明,6个油莎豆材料基因组在0.808 6~0.858 5 Gb,均值为0.826 4 Gb;基因组Survey分析结果表明,3种粒型油莎豆材料豫油莎2号、豫油莎3号、YYS-4的基因组大小、重复序列占比、GC含量、杂合率分别为0.697 9 Gb、81.02%、34.7%、0.28%,0.778 7 Gb、84.45%、36.4%、0.08%,0.790 6 Gb、83.75%、34.9%、0.19%;基因组Survey分析和花粉粒染色结果显示,3种粒型油莎豆材料均为三倍体.系统发育分析结果显示,6个油莎豆材料聚为油莎豆分支,该分支与香附子和头状穗莎草构成的分支形成亲缘关系较近的姐妹群,并与其余的C4植物(碎米莎草、长尖莎草等)构成C4植物分支.
关键词:油莎豆基因组大小基因组倍性系统发育
分类号:S565.9(经济作物)
资助基金:国家重点研发计划(2019YFD1002600)河南省重大科技专项(211100110100)河南省农业科学院新兴学科发展专项(2022XK04)河南省农业科学院自主创新项目(2022ZC13)
论文发表日期:2023-01-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 34-41 )
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