鸡GATA基因家族鉴定及生物信息学分析
孟婕
王闯
杨晴
张贝
李可强
张传生
耿立英
李祥龙
河北科技师范学院河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室,河北秦皇岛066004
摘要：为了解鸡GATA (ChGATA)家族基因特性,利用生物信息学方法对ChGATA基因家族成员进行鉴定,分析其理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、进化关系、蛋白质结构及蛋白质互作关系.结果 表明,共鉴定出6个ChGATA基因,不均匀地分布在5条染色体上.根据蛋白质保守结构域命名为ChGATA2-ChGATA6和ChTRPS1.理化性质分析结果显示,ChGATA均为无稳定的亲水蛋白质,且除ChTRPS1外均为碱性蛋白质.二级结构预测分析结果显示,ChGATA主要由无规则卷曲组成.保守结构域分析结果显示,ChGATA均包含ZnF_GATA结构域.系统进化分析结果显示,ChGATA基因家族可分为3个亚群,且同一亚群的基因结构相似、蛋白质三级结构相似、相互作用蛋白质较一致、亲缘关系较近.
关键词：鸡GATA基因家族进化分析基因结构蛋白质互作
分类号：S831.2(家禽)
资助基金：河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制项目(21326303D-5)河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目(HBCT2018150201)河北省教育厅重点项目(ZD2018034)秦皇岛市科学技术研究与发展计划项目(201903B001)河北科技师范学院博士启动基金项目(2018YB002)
论文发表日期：2021-12-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 163-169 )
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