2株伪狂犬病毒变异株全基因组测序及主要保护性抗原氨基酸变异分析
郭振华1
邢广旭1
翁茂洋1
金前跃1
乔松林1
张改平2
1.河南省农业科学院 动物免疫学重点实验室,河南 郑州 4500022.河南省农业科学院 动物免疫学重点实验室,河南 郑州 450002;河南农业大学 动物医学院,河南 郑州 450002;江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心,江苏 扬州 225009
摘要:为了解我国伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)流行毒株遗传变异情况,对分离的2株PRV(HeNLH/2017和HeNZM/2017)全基因组序列进行测定,并利用生物信息学方法进一步分析其遗传进化特征和主要保护性抗原的遗传变异情况.基因组测序结果显示,分离的2株PRV基因组全长约为143 kb,GC含量约为73.8%.遗传进化分析显示,2株PRV毒株与Bartha株、我国早期流行毒株Ea和Fa株以及2011年以来流行的变异毒株(HeN1和HN1201)核苷酸同源性分别为95.28%~95.37%、98.70%~98.80%和98.90%~99.42%.系统进化树显示,2株PRV分离株均属于基因2.2亚型(Genotype 2.2),且与变异毒株遗传关系更近.PRV主要抗原gB、gC和gD蛋白的氨基酸变异分析显示,与Bartha株相比,2株PRV分离株以及我国其他PRV流行毒株均发生了广泛的氨基酸变异,且有gB 75SPG77的缺失、gC 63AAASTPA69和gD 278S/RPRP281的插入;与我国早期流行毒株Ea和Fa相比,2株PRV分离株以及我国2011年以来流行的变异毒株的gB、gC和gD蛋白氨基酸序列同源性很高,仅在个别位点发生了突变.
关键词:伪狂犬病毒基因组测序同源性分析遗传进化氨基酸变异
分类号:S855.3(动物医学(兽医学))
资助基金:河南省农科院优秀青年科技基金(2020YQ15)国家自然科学基金(31902281)河南省重点研发与推广专项(202102110248)
论文发表日期:2021-08-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 146-153 )
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河南农业科学

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CSTPCD北大核心
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2021,50(8)
所属栏目:畜牧·兽医