猪A组轮状病毒HN2019-01株的分离鉴定及VP6基因序列分析
黄正阳1
陈宇婧1
黄克1
冷超粮2
刘阳坤2
姚伦广2
李娜2
1.南阳师范学院 生命科学与农业工程学院,河南 南阳 4730612.南阳师范学院 生命科学与农业工程学院,河南 南阳 473061;河南省畜禽保健品工程技术研究中心,河南 南阳 473061;河南省动物疫病诊断与综合防控工程技术研究中心,河南 南阳 473061
摘要:为了解猪轮状病毒(RV)在河南省的流行情况及其分子遗传特征,利用反转录PCR方法,从河南某猪场腹泻样品中扩增得到RV特异性核酸片段,并将腹泻样品利用MA-104细胞进行RV的分离和传代,将分离得到的RV命名为RVA/Pig-wt/HN2019-01.对分离毒株VP6基因片段的序列测定及生物信息学分析结果表明,分离毒株VP6核苷酸序列与猪源毒株西南株-1C(SWU-1C)相似性最高,病毒分类上同属I5亚群.VP6蛋白全长397个氨基酸,存在4个N糖基化位点和18个潜在磷酸化位点,二级结构主要由α-螺旋组成,三级空间结构与牛轮状病毒RF株VP6蛋白高度相似,且在2个细胞毒性T淋巴细胞(CTL)抗原表位区域的氨基酸序列保守.
关键词:轮状病毒A组轮状病毒病毒分离VP6基因序列分析
分类号:S855.3(动物医学(兽医学))
资助基金:国家自然科学基金(31870917)国家自然科学基金(32002302)河南省高等学校重点科研项目(18A230011)河南省科技攻关计划(182102310077)河南省疫苗工程高校科技创新团队项目(20IRTSTHN024)南阳师范学院高层次人才启动专项(2018ZX011)
论文发表日期:2021-06-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 125-133 )
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