基于SSR标记的朝天椒种质遗传多样性分析
张曼1
任佳佳1
王钦1
安朝龙1
吴培云1
谢龙安2
李伟1
1.贵州大学 农学院,贵州 贵阳 5500252.毕节职业技术学院,贵州 毕节 551700
摘要：探究以贵州为主的西南地区朝天椒种质遗传多样性,为朝天椒种质的保续、利用与分子标记辅助选择提供准确参考依据.利用20个SSR(简单串联重复序列)分子标记,对112份西南地区朝天椒种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,20对SSR引物共检测出65个等位变异,每对引物的等位变异为2～4个,平均每对引物3.25个等位变异,平均有效等位基因数为1.8294,平均多态性信息量(PIC)为0.5440,平均Shannon's信息指数(I)为0.7234,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei's期望杂合度的平均值分别为0.4920、0.4337、0.4318,所筛选出的20对SSR引物多态性较高,能较好地反映朝天椒不同地方种间的遗传多样性信息.聚类结果表明,供试材料居群间遗传相似系数(GS)值为0.5692～0.9538,平均值为0.7733,朝天椒种质间的遗传相似性相对较高,材料间的亲缘关系比较接近.在GS值0.7670处将供试材料分为4类,显示出112份朝天椒材料总体情况与地理分布有一定关联,但也存在区域间和省内外间的互相渗透,每个类别均聚集了不同地理来源的种质.
关键词：朝天椒种质资源SSR标记遗传多样性亲缘关系
分类号：S641.3(园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31760576)贵州省科技厅农业科技攻关计划(NY(2013)3024)一流学科建设项目(GNYL(2017)009)
论文发表日期：2020-07-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 101-109 )
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