大白菜BrROP基因家族的生物信息学分析
闫敏
王晗
刘少华
顾小敏
许晔
1.江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏南京 2112002.江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏南京 2112003.江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏南京 2112004.江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏南京 2112005.江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,江苏南京 211200
摘要：为了揭示大白菜BrROP基因家族的功能和进化关系,利用生物信息学方法对大白菜BrROP基因家族成员进行了鉴定,并对其基因结构、蛋白质序列、染色体定位、保守结构域、进化关系和表达模式等进行系统分析.结果表明,在大白菜基因组中共鉴定出22个BrROP基因成员,在大白菜染色体上呈不均匀分布;氨基酸序列分析表明,BrROP蛋白的结构较保守,均含有G结构域(G1—G5)、效应因子结合点、插入序列和C端可变区;根据系统发育进行聚类分析,大白菜BrROP基因可被分为4类,GroupⅠ、GroupⅡ、GroupⅢ和GroupⅣ;利用EMBL-EBI数据库对BrROP基因家族进行分析,22个BrROP基因在大白菜根、茎、叶、花和角果中呈组织差异表达.
关键词：大白菜BrROP基因家族生物信息学系统分析
分类号：S634.1(蔬菜园艺)
论文发表日期：2020-04-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 93-100 )
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