基于局域表面等离子体共振(LSPR)的核酸适配体筛选新方法的建立
郝俊芳1
张英涛2
邢广旭3
王方雨3
1.河南省农业科学院动物免疫学重点实验室,河南郑州 450002;四川农业大学动物医学院禽病研究中心,四川成都 6111302.河南省科学院生物研究所有限责任公司,河南郑州 4500083.河南省农业科学院动物免疫学重点实验室,河南郑州 450002
摘要:为了快速、高效地筛选到靶标核酸适配体,急需通过指数富集的配基系统进化技术(SELEX)建立一种简便、高效和可视化筛选适配体的新方法.以链霉亲和素(SA)作为靶标模型,利用局域表面等离子体共振(LSPR)和毛细管电泳(CE)相结合的方法进行筛选和验证.结果显示,在第1轮LSPR-SELEX中,筛选到SA结合的适配体(SBA),并且通过LSPR的Trace Drawer数据分析软件计算出SBA的KD值为107μmol/L;在第2轮LSPR-SELEX中,SBA的KD值为98 nmol/L.结果表明,采用LSPR-SELEX技术经2轮筛选,使SBA的亲和力提高了1000倍.随后,将筛选到的SBA进行CE验证,结果显示,SBA适配体与其靶标SA具有良好的亲和性和特异性.综上,鉴于LSPR从初始DNA文库中分离和收集靶标适配体的高效性,LSPR-SELEX技术可用于核酸适配体的筛选.
关键词:适配体LSPR-SELEX链霉亲和素毛细管电泳KD值
分类号:S859.84(动物医学(兽医学))
资助基金:国家重点研发计划(2018YFC1602902)
论文发表日期:2020-03-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 151-156 )
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河南农业科学

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北大核心CSTPCD
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2020,49(3)
所属栏目:畜牧·兽医