狗枣猕猴桃AkSAP蛋白的生物信息学分析
刘丹
李然红
陈鑫
王立凤
牡丹江师范学院,黑龙江 牡丹江,157012
摘要:为研究狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkSAP)的功能,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测.结果表明,AkSAP的cDNA全长为2089 bp,编码区(CDS)为1431 bp,编码蛋白为由477个氨基酸构成的非稳定亲水蛋白,属于SAP蛋白家族成员(ID:10488483),主要构件为 α-螺旋和不规则卷曲,包含锌指蛋白特有的SAP结构域,与其他17种植物的SAP氨基酸序列进行对比,与中华猕猴桃变种亲缘关系较近.
关键词:狗枣猕猴桃锌指蛋白生物信息学
分类号:S663.4(果树园艺)
资助基金:黑龙江省教育厅项目(1354MSYYB006)黑龙江省教育厅项目(1354MSYYB007)黑龙江省教育厅项目(1354ZD005)牡丹江师范学院科研项目(QN2019005)牡丹江师范学院科研项目(YB2019005)黑龙江药用植物开发与利用研究项目(1353PT007)黑龙江省大学生创新创业训练计划(201910233007)
论文发表日期:2019-12-01
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 103-108 )
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河南农业科学

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CSTPCD北大核心
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2019,48(12)
所属栏目:园艺