铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学分析
兰晓天
胡淞
冯磊
田英男
和凤美
1.云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,6506012.云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,6506013.云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,6506014.云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,6506015.云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,650601
摘要：纤维素合成酶超级基因家族是植物体纤维素合成的重要基因.为研究铁皮石斛纤维素合成酶和类纤维素合成酶基因(CESA/CSL)家族的功能,利用从铁皮石斛转录组中鉴定出的32个在茎中高表达量的纤维素合成酶超级基因家族成员为研究对象,使用MEGA 5.0、GSDS、SMART、TM-HMM、WoLF PSORT等软件对其构建系统进化树,并对基因结构及蛋白质保守结构域、跨膜结构和亚细胞定位等进行综合分析.结果显示,CESA/CSL基因在铁皮石斛不同组织中表达的数目和表达量均不同,具有组织表达特异性.铁皮石斛茎中表达量较高的CESA/CSL基因家族可分为6个亚族,外显子数目1～21个.CESA/CSL基因编码的蛋白质保守性较强,除CSLA亚族外,其余亚族均含有该基因家族的保守结构域Cellulose synthase.CESA/CSL蛋白主要分布于质膜上,大部分具有跨膜结构域.
关键词：铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学基因表达
分类号：S567(经济作物)
资助基金：国家自然科学基金(30860178)
论文发表日期：2019-08-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 49-55 )
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