百脉根PIN基因家族的鉴定与分析
吕赟1
丘日光1
杨仕梅1
吴佳海2
宋莉1
1.贵州大学 生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室,贵州 贵阳,5500252.贵州省草业研究所,贵州 贵阳,550006
摘要：生长素输出载体蛋白PIN-formed(PIN)是一类调控植物生长素极性运输的重要载体元件,与植物生长发育密切相关.利用生物信息学方法对百脉根(Lotus corniculatus)PIN基因家族成员(LjPIN)进行筛选、鉴定,并对其结构特征、系统进化、编码蛋白质性质、顺式作用元件组成和表达特性等进行研究,为其功能鉴定及利用奠定基础.结果表明,百脉根基因组中含有27个LjPIN成员,主要分布在1—5号染色体上;27个LjPIN基因含8个可变剪切位点,编码35个蛋白质;除了LjPIN4、LjPIN13、LjPIN23基因外,其他LjPIN基因均含有内含子,内含子数和外显子数均为1～10个;LjPIN与拟南芥AtPIN、大豆GmPIN在进化关系上较接近,与水稻OsPIN较远;LjPIN蛋白大多为碱性的两性稳定蛋白质,一般含有5种保守基序,基序数量2～9个;LjPIN基因除了含有顺式作用基本元件CAAT-box和TATA-box外,还含有光响应、激素响应及生长发育相关的调控元件;11个LjPIN基因在根、茎、叶、花和不同形成时期种子中呈时空差异表达.
关键词：百脉根生长素输出载体蛋白PIN基因家族生物信息学分析
分类号：S567(经济作物)
资助基金：国家自然科学基金(31660685)
论文发表日期：2019-08-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 39-48 )
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