大豆与蒺藜苜蓿Kunitz蛋白酶抑制剂的全基因组分析
缑绪卓
严子成
况玉
曹锐
陈巧灵
杨雅丽
周嘉裕
廖海
1.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100312.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100313.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100314.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100315.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100316.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100317.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,6100318.西南交通大学 生命科学与工程学院,四川 成都,610031
摘要：Kunitz蛋白酶抑制剂(Kunitz protease inhibitor,KPI)基因是植物中具有抗逆功能的基因家族之一.为研究KPI基因家族的进化与功能,对大豆和蒺藜苜蓿的KPI基因家族成员进行比较基因组学分析.利用生物信息学方法鉴定大豆与蒺藜苜蓿的KPI基因家族成员,并对其染色体定位进行分析,确定了大豆与蒺藜苜蓿KPI基因成员的直系同源与旁系同源基因及保守基序,并对大豆与蒺藜苜蓿不同组织及不同胁迫条件下KPI基因家族成员的表达情况进行了分析.结果显示,大豆、蒺藜苜蓿各含有48、46个KPI基因成员,它们在染色体上分布不均匀,并存在串联重复而形成的基因簇;大豆与蒺藜苜蓿有11对直系同源基因,二者各有14对旁系同源基因;大豆和蒺藜苜蓿均含有3个结构基序,靠近N末端的2个结构基序为大豆与蒺藜苜蓿共有,而靠近C末端的第3个结构基序位置有较大差异,可以作为区分大豆与蒺藜苜蓿KPI成员的一段特征性标记;EST(Express se-quence tags,表达序列标签)分析结果表明,KPI基因家族成员主要在根、种子中表达;干旱与盐胁迫条件下,KPI成员的数量增加,推测KPI参与了大豆与蒺藜苜蓿对干旱与盐胁迫的逆境响应过程.
关键词：Kunitz蛋白酶抑制剂大豆蒺藜苜蓿基因组生物信息学
分类号：S565.1(经济作物)S551+7(绿肥作物)
资助基金：国家自然科学基金(31500276)四川省应用基础研究计划(2017JY0222)成都市科技技术研发项目(2016-HM01-00260-SF)四川省重点研发项目(2018SZ0061)国家级大学生创新创业训练计划项目(201810613080)西南交通大学个性化实验项目(GX201812088)
论文发表日期：2019-07-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 38-47 )
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