基于转录组测序的花生籽粒不同发育时期油脂合成相关基因差异表达分析
陈玉梅
李璐璐
陈锦玲
徐媛
李惠敏
秦新民
1.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林,5410042.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林,5410043.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林,5410044.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林,5410045.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林,5410046.广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林,541004
摘要：为研究花生籽粒不同发育时期油脂合成过程中基因的表达调控模式,对花后20、35、50、60 d的花生籽粒(分别表示为HS20、HS35、HS50、HS60)进行转录组测序.通过对转录组测序数据进行分析,HS20、HS35、HS50、HS60样品的文库分别获得了109321068、106867224、109313082、107123540条Clean reads.将得到的花生籽粒转录组数据按发育时期的先后顺序进行两两比对,HS20-vs-HS35、HS35-vs-HS50和HS50-vs-HS60的差异表达基因总数分别是25769、18403、12308个,其中上调表达基因分别占12.55％ 、62.92％ 、26.28％.对差异表达基因进行KEGG Pathway分析,得到135条代谢通路,其中与油脂合成相关的有脂肪酸生物合成、不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸延长、脂肪酸代谢、花生四烯酸代谢等代谢通路.
关键词：花生转录组差异表达分析油脂合成相关基因
分类号：S565.2(经济作物)S330.2(作物遗传育种与良种繁育)
资助基金：研究生教育创新项目(XYCSZ2018056)
论文发表日期：2019-07-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：14( 24-37 )
英文信息