棉花SBP家族基因的鉴定与分析
郑玲
张欢欢
张延召
1.洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳,4710002.洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳,4710003.洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳,471000
摘要：为研究棉花Squamosa启动子结合蛋白(SBP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从棉花全基因组数据库中筛选并鉴定出83个棉花SBP家族成员,命名为GhSBP1—GhSBP83.并对该家族成员的蛋白质理化性质、多序列比对、系统进化树、基因染色体分布、基因结构、基因表达模式进行了全面分析.结果表明,棉花SBP转录因子家族可以分为8个亚族.棉花SBP基因分布在1—8号染色体以及11—13号染色体上.对NCBI中陆地棉的EST数据库进行比对分析,结果显示,40个棉花SBP转录因子家族成员在棉花的分生组织、茎、花、花芽、花药以及棉纤维中广泛表达.其中,GhSBP2、GhSBP4、GhSBP6等20多个基因在花药和棉纤维中均有表达,推测花药和棉纤维的生长发育可能同时受这些基因的控制.
关键词：棉花SBP家族基因生物信息学基因结构功能分析
分类号：S562(经济作物)
资助基金：国家自然科学基金(31400602)河南省科技攻关计划(172102310054)
论文发表日期：2019-03-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 39-48 )
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