鹰嘴豆NF-Y基因家族的全基因组序列鉴定及生物信息学分析
滕露
倪志勇
于月华
1.新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐,8300522.新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐,8300523.新疆农业大学农学院,新疆乌鲁木齐,830052
摘要：为了揭示鹰嘴豆NF-Y基因家族的功能,从鹰嘴豆全基因组中鉴定NF-Y基因,并利用生物信息学分析软件对其进行系统发育进化、染色体定位、基因结构、保守结构域以及microRNA的靶位点预测分析.结果表明,共鉴定出41个鹰嘴豆NF-Y基因家族成员,在进化上分为3个亚家族:CarNF-YA(8个)、CarNF-YB(22个)和CarNF-YC(11个);这些基因分布于7条(Ca1-Ca7)染色体上,另外还有3条序列未定位到染色体上.鹰嘴豆NF-Y家族基因序列大部分都含有1～5个内含子和1～6个外显子,少数序列如CarNF-YB9和CarNF-YC6等仅含有外显子结构;编码的蛋白质中共发现3个保守基序(Motif1、Motif2和Motif3),其中Motif1、Motif2在CarNF-YB和CarNF-YC亚家族中均有分布,而Motif3仅分布在CarNF-YA亚家族中.鹰嘴豆和拟南芥NF-Y蛋白家族成员系统进化树表明,Car/AtNF-YA可以分成6类,分别由6、1、3、3、1、4种蛋白质组成;Car/AtNF-YB可以分成4类,分别由21、8、2、4种蛋白质组成;Car/AtNF-YC亚基可以分成3类,分别由17、4、4个蛋白质组成.对鹰嘴豆NF-Y基因家族成员的miRNA169靶位点预测发现,41个成员中仅有CarNF-YA亚家族中的6个成员受到miRNA169调控.
关键词：鹰嘴豆NF-Y基因家族全基因组鉴定进化分析
分类号：S529(豆类作物)
资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金面上项目(2016D01A043)
论文发表日期：2018-10-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 38-44,63 )
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