小麦CBL4基因密码子使用特征分析
陈文烨1
焦义然1
杨军峰2
刘永伟3
杨帆3
董福双3
王海波3
杜进民4
周硕3
1.河北科技大学 生物科学与工程学院,河北 石家庄050000;河北省农林科学院 遗传生理研究所/河北省植物转基因中心,河北 石家庄0500512.河北旺丰种业有限公司,河北 邢台,0549003.河北省农林科学院 遗传生理研究所/河北省植物转基因中心,河北 石家庄,0500514.河北科技大学 生物科学与工程学院,河北 石家庄,050000
摘要：采用CodonW和Usage Codon软件分析小麦CBL4基因密码子偏好性,并将其与其他17种不同目植物CBL4基因密码子偏好性进行比较,利用最小进化法分析多种植物的亲缘关系,以期为小麦CBL4基因改良以提高对干旱、低温和盐胁迫等逆境的抗性提供理论依据.结果表明,GC含量对小麦CBL4基因密码子偏好性具有重要的影响,小麦的G+C所占比例达58.0％,其中以第3位GC含量为主,而马铃薯对密码子的使用特征与小麦差异最大,形成鲜明的对比.小麦偏好使用CUC、AGG、UAA、AUC、GUG、GCG、ACG、UGC和GGC密码子,小麦等植物密码子偏好性结果与系统发育分析得出的亲缘关系结果一致.
关键词：小麦CBL4相对同义密码子使用度密码子偏好性
分类号：S512.1(禾谷类作物)
资助基金：国家重点研发计划(2016YFD0101802)国家自然科学基金(31600216)河北省自然科学基金青年科学基金(C2017301066)创新工程项目(494-0402-YBN-RDC4)
论文发表日期：2018-08-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 11-16 )
英文信息