菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析
付苏宏
雷鸣
张勇群
施静
郝豆豆
1.西藏自治区人民政府驻成都办事处医院 分子医学实验室,四川 成都,6100412.西藏自治区人民政府驻成都办事处医院 分子医学实验室,四川 成都,6100413.西藏自治区人民政府驻成都办事处医院 分子医学实验室,四川 成都,6100414.西藏自治区人民政府驻成都办事处医院 分子医学实验室,四川 成都,6100415.西藏自治区人民政府驻成都办事处医院 分子医学实验室,四川 成都,610041
摘要：采用生物信息学的方法分析菊叶香藜3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(DsHMGR)基因所编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、亚细胞定位、保守结构域、二级结构、三级结构,并进行多条氨基酸序列比对和系统进化树构建.结果表明,DsHMGR基因包含一段1725 bp的开放阅读框,编码574个氨基酸,非极性氨基酸为主要氨基酸,等电点为7.46,为不稳定蛋白质,编码蛋白质中不含有信号肽,在N端具有2个疏水区域,含有2个跨膜结构域,DsHMGR蛋白定位到内质网上,在C端和连接区具有较高保守性,在N端保守性较低,含有HMGR蛋白特有的4个保守活性位点,二级结构主要为 α-螺旋,三级结构预测显示DsHMGR蛋白具有N、L和S 3个催化活性中心结构域.HMGR蛋白进化分析中,菊叶香藜与藜科植物聚为一支,遗传距离较近.
关键词：菊叶香藜萜类化合物3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)生物信息学
分类号：S567.21+9(经济作物)Q949.745.1(植物分类学（系统植物学）)
资助基金：国家自然科学基金(2015ZR-13-5)
论文发表日期：2018-07-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 59-66,89 )
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