胡黄连GPPS基因的生物信息学分析
郑雪
王慧娜
朱彦秋
丁卫凯
李娇娇
周延清
段红英
1.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,4530002.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,4530003.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,4530004.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,4530005.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,4530006.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,4530007.河南师范大学生命科学学院,河南新乡,453000
摘要：为了解胡黄连GPPS基因及其编码蛋白的生物学特性,并推测其功能,综合运用DNAMAN、MEGA6、Blast、Blastp和TMHMM Server等软件,分析了胡黄连GPPS基因序列及其编码蛋白的理化性质、结构域等,并对部分高等植物GPPS蛋白序列进行了比对和进化树构建.结果表明,胡黄连GPPS基因包含一个1 116 bp的开放阅读框(ORF),共编码371个氨基酸,编码蛋白为亲水性蛋白,很可能定位于叶绿体上,定位系数为6;金鱼草、小花茉莉GPPS基因编码蛋白与该蛋白相似度较高,分别为74％和77％.此外,空间结构分析和序列比对结果都表明,胡黄连GPPS基因编码蛋白与类异戊二烯合酶蛋白具有较高的相似度,推测胡黄连GPPS基因为植物萜类合成途径组分之一.
关键词：胡黄连GPPS基因生物信息学萜类物质
分类号：S567(经济作物)
资助基金：国家自然科学基金(31500262)河南省高等学校科技创新人才支持计划(17HASTIT034)
论文发表日期：2018-06-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 104-110 )
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