谷子Hd1-like基因的克隆及其与农艺性状的关联分析
袁玺垒
戴凌峰
张小梅
郁飞燕
贾小平
1.河南科技大学农学院,河南洛阳,4710232.河南科技大学农学院,河南洛阳,4710233.河南科技大学农学院,河南洛阳,4710234.河南科技大学农学院,河南洛阳,4710235.河南科技大学农学院,河南洛阳,471023
摘要:为揭示谷子光周期敏感性分子机制和拓宽谷子育种选择范围,对光周期途径关键基因进行研究.选择11个谷子品种鉴定了抽穗日数、株高、穗粗、穗粒质量、码粒数、千粒质量等9个农艺性状,利用同源克隆法克隆了这些谷子品种CO(CONSTANS)基因的同源基因Hd1-like基因,初步进行了基因突变位点与表型性状的关联分析.结果表明:多数性状在11个谷子品种间存在显著差异,表现出丰富的表型多样性;抽穗日数、株高与多个穗部性状存在显著或极显著正相关,反映了这2个性状对谷子产量潜能存在重要影响;Hd1-like基因编码区内共检测到43个突变位点,全部为SNP,主要为A/G、T/C替换,连锁不平衡分析发现,有2组最大的连锁不平衡结构,一组包括位点71、1023、1117、1406、1875、2073,另一组包括位点134、185、921、1131、1187、2098;对11个谷子品种Hd1-like基因推定的蛋白质序列分析发现,该蛋白质N端具有明显的锌指结构,C端具有明显的CCT域,Hd1蛋白在11个谷子品种间存在15处氨基酸替换突变,其中第44个氨基酸酪氨酸和半胱氨酸之间替换、第334个氨基酸精氨酸和甘氨酸之间替换,分别位于锌指区域和CCT域内,而位于锌指区的氨基酸替换可能导致了郑州12对光周期敏感度减弱;关联分析检测出12个与表型性状关联的位点,其中7个位点与千粒质量关联,1个位点与抽穗日数关联,2个位点与株高关联,2个位点与穗粗关联,说明该基因可能是一个多效基因.
关键词:谷子光周期Hd1-like基因关联分析
分类号:S515(禾谷类作物)
资助基金:国家自然科学基金(31471569)
论文发表日期:2018-06-02
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 24-30 )
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