基于RNA-seq技术的甘蓝型油菜新转录本的鉴定
徐文1
安素妨1
王艳1
贾琳琳1
鲁丹丹1
张莹莹1
刘建丰2
李保全1
1.河南省农业科学院作物设计中心,河南郑州,4500022.河南省农业科学院农业经济与信息研究所,河南郑州,450002
摘要：为了鉴定甘蓝型油菜基因组中新的未知转录本,以甘蓝型油菜叶片为材料提取总RNA,构建cDNA文库并使用Illumina双端测序Hiseq 2500平台进行测序.用生物信息学的方法分析高质量的测序reads来鉴定新的未知转录本.结果表明,在甘蓝型油菜基因组已知基因的间隔区共鉴定到7 720个候选新转录本,通过RT-PCR和克隆测序验证了15个新鉴定的转录本.
关键词：甘蓝型油菜转录组测序新转录本RNA-seq
分类号：S513(禾谷类作物)
资助基金：河南省基础与前沿技术研究计划(162300410153)
论文发表日期：2018-04-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 38-42 )
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