大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析
钟静1
吴小明2
胡颖3
1.湖北第二师范学院/植物抗癌活性物质提纯与应用湖北省重点实验室,湖北 武汉430205;武汉大学/杂交水稻国家重点实验室,湖北 武汉 4300722.湖北第二师范学院/植物抗癌活性物质提纯与应用湖北省重点实验室,湖北 武汉,4302053.武汉大学/杂交水稻国家重点实验室,湖北 武汉,430072
摘要：基于已公布的大豆基因组数据库,鉴定大豆类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)基因,并对其基本理化性质、保守基序、功能域、系统发生树、蛋白质二级结构等进行综合分析.结果显示,从大豆基因组中共鉴定出33个FLAs,其编码的蛋白质氨基酸长度在237~455 aa,分子质量在25.483 0~50.578 5 ku,理论等电点在4.33~9.56.亚细胞定位分析显示,GmFLAs均定位在质膜上(其中GmFLA4/25也可定位在叶绿体中).GmFLAs含有1~2个该家族的保守成束蛋白质结构域(fasciclin domains,FAS).系统进化分析显示,大豆和拟南芥FLAs的同源性不高.GmFLAs二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等元件组成,其中,延伸链的比例最低,无规则卷曲比例最高.
关键词：大豆类成束阿拉伯半乳糖蛋白理化性质结构特征生物信息学分析
分类号：S565.1(经济作物)
资助基金：Trans助研梦想基金项目(Trans;Trans-RasDF-019)
论文发表日期：2017-03-02
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 34-40 )
英文信息