拟南芥和水稻CesA基因家族的生物信息学分析
王振怡
王金朋
潘玉欣
张家琦
王希胤
1.河北联合大学 生命科学学院 基因组学与计算生物学研究中心,河北 唐山,0630092.河北联合大学 生命科学学院 基因组学与计算生物学研究中心,河北 唐山,0630093.河北联合大学 生命科学学院 基因组学与计算生物学研究中心,河北 唐山,0630094.河北联合大学 生命科学学院 基因组学与计算生物学研究中心,河北 唐山,0630095.河北联合大学 生命科学学院 基因组学与计算生物学研究中心,河北 唐山,063009
摘要:以拟南芥和水稻21个纤维素合成酶基因( CesA)为研究对象,对其基因结构、保守结构域、蛋白质跨膜结构、亚细胞定位、基因表达等进行综合分析。结果显示,CesA基因长度在3.5~6.5 kb,有7~13个内含子( OsCesA10除外)。 CesA基因编码的蛋白质保守性较强,含有该基因家族的保守结构域Ring finger( OsCesA10、OsCesA11除外)和Cellulose synthase。水稻和拟南芥的CesA蛋白跨膜螺旋数量为6个或8个( OsCesA10除外)。蛋白质亚细胞定位结果表明,21条CesA蛋白全部定位在质膜上。大部分AtCesA基因在植株的幼根、幼叶和愈伤组织中均有表达,而大部分OsCesA基因仅在幼根或幼叶中表达。
关键词:纤维素合成酶基因拟南芥水稻生物信息学基因表达
分类号:Q51(蛋白质)S511(禾谷类作物)
资助基金:国家自然科学基金(31170212)河北省教育厅项目(Y2012025)河北省科技厅项目(14962905D)河北联合大学自然科学研究基金项目(z201235,z201230)
论文发表日期:2015-01-01
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 13-17 )
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河南农业科学

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北大核心CSTPCD
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2015,(6)
所属栏目:作物栽培? 遗传育种