谷子、玉米重复基因间基因置换的系统发育分析
王金朋
聂林曼
王振怡
马雪莲
张琼
1.河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山,0630092.河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山,0630093.河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山,0630094.河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山,0630095.河北联合大学生命科学学院基因组学与计算生物学研究中心,河北唐山,063009
摘要：以谷子和玉米为研究对象,利用系统发育分析和比较基因组学推断了重复基因间可能的基因置换,旨在对其基因组中由全基因组加倍产生的重复基因的相互作用机制进行研究.结果表明,谷子中有192对(18.9％)、玉米中有121对(11.9％)的重复基因在其进化过程中发生了基因置换,且重复基因对之间的置换常常是以部分基因置换为主,谷子发生置换的基因对中有88.4％、玉米中有76.5％是部分基因置换;基于动态规划和系统发育相结合的方法,确定了谷子、玉米多个重复基因对间发生过不止1个片段的基因置换;对基因置换与重复基因在染色体上物理位置的相关性分析发现,基因置换与基因在染色体上的位置显著相关,对不同染色体区域重复基因发生置换的频率进行统计分析表明,靠近染色体末端的重复基因对更易发生置换.
关键词：谷子玉米重复基因基因置换系统发育分析
分类号：S513(禾谷类作物)S515(禾谷类作物)
资助基金：国家自然科学基金(31100913)河北联合大学科研项目(z201230)河北联合大学科研项目(z201235)河北联合大学大学生创新性实验计划(X2013044)
论文发表日期：2014-12-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 34-39 )
英文信息