希金斯炭疽菌中5个典型Septin的生物信息学分析
韩长志
西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明,650224
摘要:希金斯炭疽菌可以侵染菜心、萝卜等众多十字花科蔬菜引起炭疽病,给农业生产造成巨大的经济损失.septin是一个广泛存在于除植物以外其他生物的基因家族,其功能与细胞分裂、细胞内物质运输以及细胞周期的调控与细胞凋亡等关系密切,将成为新开发药物的潜在靶标.基于酿酒酵母中7个典型Septin蛋白的氨基酸序列,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对和关键词搜索,并通过SMART在线分析最终明确希金斯炭疽菌中含有5个典型的Septin.同时,从理化性质、跨膜区结构、二级结构以及亚细胞定位等方面对Septin进行生物信息学分析,结果显示,上述Septin均为亲水性蛋白,且不具有跨膜结构,其二级结构及亚细胞定位情况不同.
关键词:希金斯炭疽菌Septin蛋白生物信息学分析理化性质亚细胞定位二级结构
分类号:S436.3(病虫害及其防治)
资助基金:云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK11A101)云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目(ZK11SB01)云南省重点学科森林保护学科研项目(XKZ200905)
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 91-96 )
英文信息展开
河南农业科学

河南农业科学

北大核心CSTPCD
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2014,43(8)
所属栏目:植物保护