黄瓜绿斑驳花叶病毒抗原表位预测
杨洪一1
孙立娜1
张杰2
任静2
1.东北农业大学,黑龙江哈尔滨,1500302.东北农业大学,黑龙江哈尔滨150030;东北林业大学生命学院,黑龙江哈尔滨150040
摘要：探索通过生物信息学方法预测黄瓜绿斑驳花叶病毒(cucumber green mottle mosaic virus,CGMMV)的抗原表位,为基于抗原表位策略制备CGMMV抗血清打下基础.利用MEGA软件中的邻近算法对CGMMV进行系统进化分析,结果显示,不同CGMMV分离物可分为2个类群,不同分离物间未见明显的寄主相关性和地理相关性.应用不同生物信息学软件对CGMMV外壳蛋白不同区域的抗原指数、蛋白二级结构进行分析,结合外壳蛋白三级结构预测结果综合分析,CGMMV外壳蛋白抗原表位区可能位于N端3-15、80-90、90-100位氨基酸残基附近.
关键词：黄瓜绿斑驳花叶病毒抗原表位系统进化分析蛋白结构
分类号：S436.421.1(病虫害及其防治)
资助基金：黑龙江省教育厅科研项目(11541033)
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 67-70 )
英文信息