拟南芥核苷二磷酸激酶基因家族的生物信息学比较与分析
孙小洁
王增兰
1.山东师范大学山东省逆境植物研究重点实验室,山东济南,2500142.山东师范大学山东省逆境植物研究重点实验室,山东济南,250014
摘要：为研究拟南芥核苷二磷酸激酶家族(AtNDPKs)5个成员之间的差异,对其在蛋白质结构、磷酸化位点、信号肽序列、功能区方面的差异进行了生物信息学的比较分析,并建立了系统进化树.结果显示,5个成员在等电点、吸光值和亲水性方面的差异明显.二级结构中,AtNDPK2的α螺旋比例与其他成员差异显著；在β转角和无规则卷曲方面,AtNDPK1a与AtNDPK3a表现出相反的情况.5个成员各含有1个NDK结构域,但分布位置不同.AtNDPK3a中酪氨酸磷酸化明显增多,AtNDPK1a的磷酸化位点与其他成员差异显著.AtNDPK1和AtNDPK2的信号肽裂解点位于第16和17位氨基酸之间,AtNDPK3和AtNDPK3a的位于第42和43位之间,而AtNDPK1a的位于第24和25位之间.AtNDPK1a的进化地位高于其他成员,AtNDPK3与AtNDPK3a的亲缘关系最近,而AtNDPK1与其他成员的亲缘关系较远.
关键词：拟南芥生物信息学核苷二磷酸激酶家族序列分析系统分析
分类号：Q71(生物大分子的结构和功能)
资助基金：山东省自然科学基金项目(ZR2010CM036)
论文发表日期：2012-01-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 38-44 )
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