大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析
吴卓晶1
庞保平2
傅永福3
1.内蒙古农业大学,农学院,内蒙古,呼和浩特,010019;中国农业科学院,作物科学研究所,北京,1000812.内蒙古农业大学,农学院,内蒙古,呼和浩特,0100193.中国农业科学院,作物科学研究所,北京,100081
摘要:利用Phytome、 TAIR、 NCBI网站及其数据库和MEGA 4.0、Clustal X软件,对大豆(Glycine max)基因组中TOC1同源基因进行了生物信息学分析,确定了GmTOC1基因及其在染色体上的物理分布、内含子-外显子结构,进行了氨基酸序列比对,并研究了其系统发育学地位.结果表明,GmTOC1与AtTOC1亲缘关系较近,都具有保守的调节区域,而且可能具有相似的生物钟调控功能.此外发现,大豆基因组中含有4个拷贝的TOC1同源基因,它们在生物进化过程中保留了与拟南芥同源的结构和功能.
关键词:大豆TOC1生物钟开花系统发育
分类号:S565.1(经济作物)
资助基金:国家高技术研究发展计划(863计划)(2007AA10Z119)国家高技术研究发展计划(863计划)(2006AA10A111)
论文发表日期:2010-08-01
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 22-27,32 )
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河南农业科学

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北大核心
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2010,(8)