黄瓜黑星病菌核糖体基因ITS区段的克隆及序列分析
高永洋
高观朋
王倩倩
王伟
1.华东理工大学,生物反应器工程国家重点实验室,上海,2002372.华东理工大学,生物反应器工程国家重点实验室,上海,2002373.华东理工大学,生物反应器工程国家重点实验室,上海,2002374.华东理工大学,生物反应器工程国家重点实验室,上海,200237
摘要：为了探讨枝孢霉属的系统发育情况,采用真菌核糖体基因转录间隔区域(ITS)通用引物,PCR扩增3株来自不同地方的黄瓜黑星病菌核糖体基因的ITS序列,并对PCR产物进行测序和序列分析.结果表明:3株黄瓜黑星病菌之间同源性为100%,ITS全长463bp,其中ITS1长154bp,5.8S rDNA长159bp,ITS2长150bp,各碱基的个数分别为G 119个、C 118个、A 120个、T 106个,GC含量为51.2%.利用MEGA4软件中的NJ法和ME法,对3个样品序列以及Gen Bank中登陆的枝孢霉属其他25个种构建ITS聚类分析树状图,NJ法和ME法构建的结果基本相同,枝孢霉属可以分为5个聚类组,所测的3个样品和Cladosporium cucumerinum在一个聚类组中.
关键词：黄瓜黑星病菌核糖体基因转录间隔区聚类组
分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家自然科学基金(30871664)国家科技攻关计划(08391911400)上海市农转资金项目(073419N09)
论文发表日期：2009-01-01
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 78-83 )
英文信息