用SAM法分离谷子SSR位点的研究
贾小平1
王天宇2
黎裕2
宋燕春2
石云素2
1.河南科技大学,农学院,河南,洛阳,4710032.中国农业科学院,作物科学研究所,北京,100081
摘要:首次将SAM(选择扩增微卫星)法用于谷子SSR位点的分离,共获得163个含有SSR序列的克隆,其中unique SSR 106个,占所有SSR序列的65%, 60个SSR序列的3′端成功设计特异引物,占unique SSR的56%.这60个SSR序列中,55个为完整型重复;5个为复合型重复,由2种不同的重复单元组成,没有发现不完整重复类型.同时讨论了SAM法在应用过程中应注意的一些关键技术环节,如接头连接、核苷酸选择策略、特异引物设计原则,及该方法存在的一些不足,如获得SSR重复次数少、一端侧翼序列缺失对扩增多态性的消极影响等.
关键词:谷子选择扩增微卫星法SSR
分类号:S515(禾谷类作物)
资助基金:国家自然科学基金(2005CCA02500)国家自然科学基金(2005DIA4J019)
论文发表日期:2009-08-01
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 17-21 )
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河南农业科学

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CSTPCD北大核心
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2009,(8)
所属栏目:作物栽培·遗传育种